Trên địa bàn quận có mạng lưới trường học dày đặc đầy đủ các cấp học: Tiểu học, THCS, THPT, Đại học. Tất cả đều là những ngôi trường có danh tiếng và uy tín của Thành phố Hà Nội. Giáo dục Long Biên luôn đi đầu Thành phố Hà Nội về công tác giáo dục tại địa phương và được Chủ tịch nước, Chính phủ, Bộ Giáo dục và Đào tạo, Thành phố Hà Nội trao tặng rất nhiều bằng khen trong công tác thực hiện giáo dục tại địa phương. Các trường THPT do Sở Giáo dục và Đào Tạo Hà Nội quản lí cũng là những ngôi trường có uy tín, chất lượng giáo dục đạt chuẩn; là những trường đạt chuẩn Quốc gia mức độ I. Đặc biệt, Trường THPT Vạn Xuân - Long Biên là ngôi trường ngoài công lập nhưng lại có chất lượng giáo dục không kém các trường công lập và được coi là ngôi trường dẫn đầu khối trường THPT ngoài công lập trong cụm Long Biên - Gia Lâm

- Các Trường THPT: THPT Nguyễn Gia Thiều (1950), THPT Vạn Xuân - Long Biên (2000), Trường Phổ thông Song ngữ Liên cấp Quốc tế Wellspring (2011), THPT Lý Thường Kiệt (2002), THPT Thạch Bàn (2012), THPT Phúc Lợi (2014), Trường Việt Pháp ALEXANDRE YERSIN - Ngọc Thụy (2019).

- Các Trường Tiểu học: Đức Giang, Ngọc Lâm, Ngọc Thụy, Long Biên, Thạch Bàn, Cự Khối, Gia Thụy, Thượng Thanh, Đoàn Kết, Vũ Xuân Thiều, Giang Biên, Thanh Am, Ngô Gia Tự, Lý Thường Kiệt, Ái Mộ A, Ái Mộ B.